Бегонии однозначно выкопать, у нас они не зимуют.
Но и дома она не долго будут радовать. Им продолжительный период покоя нужен.
Они сами обычно начинают постепенно подсыхать.
Вроде положено клубни выкапывать и хранить в холодильнике или подвале. Я оставляю их "зимовать" прямо в горшках. Подвала нет, так что просто выбираю тёмное место попрохладнее.